Camp om bioinformatik og miljø-DNA

Naturovervågning er til tider vanskeligt og dyrt og har sjældent politisk prioritet. Her er DNA fra miljøprøver (miljø-DNA eller eDNA) en lovende ny metode til overvågningen af vores biodiversitet – fra bakterier til blåhvaler – blot ved at tage et glas vand.

På denne camp skal vi arbejde med bioinformatik og miljø-DNA – både teoretisk og i praksis. Vi skal ud og samle prøver i Sorø Sø og derefter undersøge om der findes en bestemt type organisme i søen. For at lykkedes med det, skal vi blandt andet selv designe primere til PCR.

Bioinformatik

Bioinformatik er et tværfagligt forskningsfelt med udgangspunkt i biologi, som beskæftiger sig med at analysere store mængder af biologiske data. Bioinformatiks overordnede mål er at beskrive biologiske sammenhænge, og brugen af computere er en del af forskningen.

Miljø-DNA

Miljø-DNA (også kaldet eDNA) er rester af DNA som findes i omgivelserne uden for en organisme. Alle organismer efterlader DNA-spor i sine omgivelser via lækage fra hud, blade, sporer, saliva (spyt), afføring, osv. Det findes teknikker til at indsamle denne type af DNA – og med hjælp af DNA-stregkodning spore organismer, som har haft kontakt med miljøet, uden nogensinde at se en organisme eller vævsdele. Teknikken forventes at have potentiale inden for fx miljøovervågning. Såvel kontrol med invasive arter som beskyttelse af de truede er blandt nogle af de mange perspektiver ved eDNA